By Wolfgang Gentzsch (auth.), Hans-Werner Meuer (eds.)
"SUPERCOMPUTER `92 - Anwendungen, Architekturen, developments" enth{lt alle Vortr{ge des f}hrenden Seminars }ber dieses Fachgebiet im deutschsprachigen Raum. Der Band ist f}r Supercomputer-Anwender, -Betreiber und -Hersteller sowie f}r Entscheidungstr{ger und Planer im Bereich der Informationsverarbeitung ein untentbehrliches Hilfsmittel, um in diesem unerh|rt innovativen Gebiet Schritt halten zu k|nnen. Er versetzt dar}ber hinaus Informatiker aus Hochschulen und Forschungsinstituten in die Lage, existierende Probleme in der Supercomputer-Praxis besser verstehenund einordnen zu k|nnen.
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Die vorliegende Arbeit entstand wahrend meiner Tatigkeit als wissenschaftlicher Mitar beiter am Institut fur Steuerungstechnik der Werkzeugmaschinen und Fertigungseinrich tungen (ISW) der Universitat Stuttgart. Mein besonderer Dank gilt Herrn Prof. DrAng. A. Storr fur seine Unterstutzung und seine kritischen Anregungen bei der Erstellung dieser Arbeit sowie fur die Ubernahme des Hauptberichts.
Darstellungen von Gruppen: Mit Berücksichtigung der Bedürfnisse der Modernen Physik
Die Matrizen, die zu Transpositionen gehören, nicht nur (wie bei der natürlichen Darstellung) leicht berechnen, sondern unmittelbar hin schreiben kann. Und die orthogonale Darstellung ist es ja, die bei den Anwendungen speedy immer gebraucht wird (IV § five und 6). In VIII § five ist die Freudenthalsche explizite Spindarstellung der Drehgruppe hinzugekommen, die ebenso wie der oben genannte Satz über die Darstellungsgrade bereits in die 1963 erschienene englische Ausgabe des Buches aufgenommen worden conflict.
Nach der Methode der kleinsten Quadrate nebst Anwendung in der Geodsie.
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Wasserman vom Los Alamos National Lab durchgefiihrte Benchmark zeigt folgende Ergebnisse im Vergleich zur CRAY Y-MP: 2,5 2,1 2,0 1,9 1,9 1,5 1,0 0,5 0,0 NEC SX-3114 Fujitsu VP2600/10 • Mittel Skalar o Mittel Gesamt Abbildung 15: LANL Benchmarks CRA Y Y-MP C9011 58 7000 6192 6000 5000 4000 3000 2000 1000 0 CRAYY- CRAYY- CRAYY- CRAYY- NECSXMP MP C90/8 MP C9014 MP/8 3144 NECSX3/34 CRAY2S/8 CRAYY- NECSXMP/4 3124 C90/16 Abbildung 12: Linpack 100 x 100 Durchsatz Diese Betrachtungsweise verdeutlicht die Uberlegenheit der CRAY-Architektur, bei der man sich bewuBt fUr mehr Prozessoren und weniger Pipes entschieden hat.
In the simulation, the classical mechanical equations of motion are solved numerically for the following system: a bovine pancreatic trypsin inhibitor mutant (a protein consisting of 58 polymer units with 578 atoms), 6 chloride counter ions and 2358 water molecules. The intermolecular potential was cut off at a range of 12 A and the nearest neighbor pair list of irlteracting atoms updated every 10 steps. Temperature and pressure are held constant. 6 sec CPU time. 45 chain positions 5, 14, 38 and 55 mutated to serine) was simulated for comparison with experimental results obtained with nuclear magnetic resonance spectroscopy (Tom Creighton and colleagues, EMBL).
The lines are (virtual) connections between the centers of the polymer units, the dotted line is a chemical link between units number 30 and 51. The mean diameter of the molecule is about 20 A. The interatomic packing is so tight that water is all but excluded from the core of the molecule. However, without the surrounding water the simulation would be physically unrealistic. The price paid is a manyfold increase of the total CPU effort. The 200 picosecond simulation was carried out by Pieter Stouten, Protein Design Group, EMBL, on a Fujitsu FACOM supercomputer using the GROMOS program suite [10], and required more than 100 hours CPU time.